Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbx1P41778 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbx1P41778 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms