Protein–RNA interactions for Protein: P41731

Cd63, CD63 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd63P41731 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd63P41731 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd63P41731 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd63P41731 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd63P41731 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd63P41731 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd63P41731 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms