Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbP41155 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LtbP41155 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LtbP41155 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtbP41155 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LtbP41155 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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