Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl28P41105 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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