Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sox7P40646 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox7P40646 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox7P40646 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox7P40646 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox7P40646 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox7P40646 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox7P40646 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox7P40646 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox7P40646 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox7P40646 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox7P40646 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox7P40646 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms