Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VhlP40338 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VhlP40338 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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