Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FynP39688 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FynP39688 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FynP39688 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FynP39688 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FynP39688 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FynP39688 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FynP39688 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FynP39688 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FynP39688 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FynP39688 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FynP39688 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FynP39688 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms