Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpargP37238 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PpargP37238 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpargP37238 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpargP37238 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpargP37238 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpargP37238 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpargP37238 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms