Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RetP35546 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RetP35546 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RetP35546 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RetP35546 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RetP35546 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms