Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6dP35459 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms