Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TpoP35419 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpoP35419 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpoP35419 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TpoP35419 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpoP35419 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpoP35419 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpoP35419 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TpoP35419 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TpoP35419 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TpoP35419 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TpoP35419 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TpoP35419 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms