Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab21P35282 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab21P35282 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab21P35282 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms