Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola1P33609 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pola1P33609 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms