Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch4P31695 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms