Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif5cP28738 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif5cP28738 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms