Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxrgP28705 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxrgP28705 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms