Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb1P28230 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms