Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms