Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpbP27790 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpbP27790 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpbP27790 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms