Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms