Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna1P26231 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms