Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk11bP24788 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms