Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf5P24699 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myf5P24699 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms