Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd247P24161 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd247P24161 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms