Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd11P23813 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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