Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms