Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prim1P20664 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prim1P20664 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim1P20664 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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