Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms