Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms