Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcer1aP20489 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms