Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VimP20152 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VimP20152 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VimP20152 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VimP20152 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VimP20152 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VimP20152 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VimP20152 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VimP20152 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VimP20152 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VimP20152 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VimP20152 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VimP20152 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VimP20152 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VimP20152 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms