Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms