Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnc1P19123 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms