Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RargP18911 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RargP18911 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RargP18911 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms