Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18533 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18533 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18533 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P18533 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18533 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms