Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18532 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18532 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18532 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18532 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18532 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18532 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18532 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18532 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18532 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18532 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18532 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18532 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18532 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18532 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18532 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18532 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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