Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpraP18052 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtpraP18052 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpraP18052 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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