Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PcnaP17918 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcnaP17918 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PcnaP17918 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PcnaP17918 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PcnaP17918 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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