Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkceP16054 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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