Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrphP15331 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrphP15331 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrphP15331 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrphP15331 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrphP15331 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrphP15331 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms