Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dnmt1P13864 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Dnmt1P13864 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.7 ms