Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms