Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms