Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms