Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Schip1P0DPB4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms