Protein–RNA interactions for Protein: P0DN91

Tmem254c, Transmembrane protein 254c, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254cP0DN91 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem254cP0DN91 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms