Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb7P09024 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms