Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NeflP08551 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NeflP08551 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NeflP08551 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NeflP08551 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NeflP08551 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NeflP08551 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NeflP08551 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NeflP08551 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeflP08551 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeflP08551 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms