Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms