Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Egr1P08046 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms